苗木公司在交税方面主要涉及以下几种情况：
如果苗木公司自己种植苗木并进行销售，则销售自产苗木属于免税行为，免征增值税和企业所得税。
如果苗木公司外购苗木后再进行销售，则需要按照规定的税率缴纳增值税。具体税率根据苗木是用于自己种植还是其他用途有所不同：
用于自己种植的苗木：销售外购苗木部分不缴纳增值税，但建筑安装服务应如何处理需要进一步明确。
用于其他用途的苗木：销售外购苗木部分需要按照规定的税率（如13%）缴纳增值税。
如果苗木公司同时提供园林绿化施工服务和苗木销售，则按照混合销售的定义进行处理：
苗木作为货物销售时，按照销售货物缴纳增值税。
园林绿化施工服务作为服务销售时，按照提供的服务缴纳增值税。
苗木种植企业可以享受免征企业所得税的优惠政策，但需要在汇算清缴期内向主管税务机关提出书面备案申请并报送相关资料。
除了增值税和企业所得税外，苗木公司还需要缴纳其他税种，如城市维护建设税、教育费附加税等。
建议
苗木公司在销售苗木时，应明确区分自产和外购苗木，并根据相关税收政策进行申报和缴纳税款。
对于同时提供苗木销售和园林绿化施工服务的企业，需要仔细考虑混合销售行为的税务处理，确保合规操作。
及时向主管税务机关提交免税申请和相关资料，以享受企业所得税的优惠政策。
保留好所有相关的合同、发票和财务记录，以备税务机关检查。
